Система АП - это научно обоснованное, логично последовательное размещение аграрно-правовых институтов, нормами которых регулируются общественные аграрные правоотношения субъектов аграрного предпринимательства всех форм собственности и хозяйствования.
Обозначение системы АП имеет как теоретическое (научное) так и практическое значение (систематизация законодательства, научно-обоснованное обозначение понятия АП и т.д.)
Как и в случае с другими отраслями права, АП состоит из:
1) Общей части
2) Особенной (специальной) части
В общей части содержится (изучается) сущность аграрно-правовых норм, их структура, характер и направление регулирования аграрных правоотношений, источники АП, субъекты АП, формы государственного регулирования аграрных правоотношений.
В особенной части содержится: правовое регулирование финансовой деятельности, правовое регулирование организации и оплаты труда, договорные отношения в АПК, защита прав сельхозтоваропроизводителей, ответственность за нарушение норм АП и т.д.