Водоисточники обеззараживают после дегазации прилегающих к ним участков территории. Дегазацию шахтных колодцев или ключевых источников проводят путем многократного откачивания воды. Для этого из них вычерпывают (выкачивают) всю воду, дно посыпают хлорной известью, а стенки обмазывают ее кашицей. Затем с дна снимают слой грунта до 10 см и обмывают стенки колодца набравшейся водой, после чего ее вычерпывают.
Воду дегазируют только в крайних случаях, при невозможности доставить необходимое количество чистой воды из незараженных источников. Воду, зараженную ХОВ (ОВ), дегазируют химическим и сорбционным способом, а в отдельных случаях кипячением.
Химический способ основан на хлорировании зараженной воды с последующим удалением избытка хлора. Хлорную известь берут из расчета 30−50 мг активного хлора на литр воды. Хлор должен находиться в контакте с водой не менее 8 ч. Избыток хлора удаляется путем добавления гипосульфита натрия или фильтрованием через активированный уголь.
Сорбционный способ дегазации воды заключается в том, что зараженную воду фильтруют через слой активированного угля, который хорошо очищает воду от иприта, люизита, фосфорорганических ХОВ (ОВ).
Кипячением дегазируют воду, зараженную нестойкими ХОВ (ОВ) и парообразным ипритом.