Основное направление научных исследований на кафедре «Физика-2» - физика твёрдого тела; интересы сотрудников кафедры лежат в области изучения оптических, электрических и магнитных свойств твёрдых тел. Работы ведутся в тесном сотрудничестве с академическими организациями (ФИАН,ИКАН и т.д.) и университетами (например, МГУ им. М.В. Ломоносова, МЭИ, ТГУ и др.) в соответствии с Координационными планами АН России и полученными грантами; они регулярно включаются в Программу фундаментальных и поисковых научных исследований МИИТа: тема «Фундаментальные и поисковые научно-исследовательские работы в области железнодорожного транспорта, раздел «Проблемы физики». Помимо данной темы на кафедре проводятся работы в рамках международных договоров о сотрудничестве с Тартуским государственным университетом (Эстония; руководитель - проф. В.А. Никитенко), Институтом физики НАН Белоруссии и Физическим институтом РАН (руководитель - проф. В.А.Никитенко) и Высшей школой техники и экономики г. Дрездена (ФРГ; руководитель проф. Пахомова Н.Л); проф. Тимофеев Ю.П. руководит рядом научных тем в отделении оптики ФИАН; ведётся научно-методическая тема «Обобщение опыта и совершенствование системы подготовки специалистов на кафедрах физики транспортных вузов».
Об уровне научных результатов, получаемых на кафедре, говорит, например, то, что только за последние пять лет её сотрудниками опубликовано более двухсот печатных работ, сделано более 90 докладов на всероссийских и международных совещаниях, конференциях. Так, например, сотрудники кафедры принимали участие в работе конференций в Китае (1994 г.), Австрии (1994), Польше (1994), Индии (1995), Италии (1995), Чехии (1996), Франции (1997), Испании (1998), Вьетнаме (2000 и 2002), США (2003), Словакии (2005) и в ряде других стран. Статьи по результатам исследований публикуются в таких международных журналах, как «Journal of Physics & Chemics of Solids», «Physica Status Solidi», «Proceedings of Moscow Physical Society», «Radiation Measurement», «Журнал физической химии», «Неорганические материалы», «Поверхность (физика, химия, механика)», «Журнал прикладной спектроскопии», «Известия вузов», «Металлы», «Физика и техника полупроводников» и других, некоторые публикации выходят в соавторстве со студентами. С 1995 по 2005 год опубликованы 15 книг (в том числе - учебные пособия), такие, например, как «Физика твёрдого тела» (Верещагин И.К., Кокин С.М., Никитенко В.А., Селезнёв В.А., Серов Е.А., 1998 и 2001); «Сборник задач по физике» (Ильин С.И., Никитенко В.А., Прунцев А.П., 2001 и 2004), «Концепции современного естествознания» (Никитенко В.А., Прунцев А.П., 1997 и 2002, 2004), «Рождение изобретения» (Гасанов А.И., Гохман Б.М., Ефимочкин А.П., Кокин С.М., Сопельняк А.Г., 1995), «Физика на железнодорожном транспорте» (Кокин С.М., Селезнёв В.А, 1995). Кафедра имеет ежегодно обновляемый стенд основных научных публикаций.
По итогам научных публикаций двое из профессоров кафедры являются членами Нью-йоркской Академии наук, профессора кафедры стали членами научных Советов РАН, готовят аспирантов к защите кандидатских диссертаций.
Сегодня продолжает активно работать научная школа в области люминесценции твердых тел и оптоэлектроники, созданная профессором, доктором ф.-м.наук, заслуженным деятелем науки и техники РСФСР Верещагиным И.К. Совместно с сотрудниками кафедры им разработана теория электро- и фотолюминесценции кристаллов, а также процессов, определяющих срок службы источников света; выполнен цикл работ по физическим основам люминесцентных приборов для отображения информации, которые используются на транспорте. Самостоятельное развитие получили такие важные направления, как спектроскопия экситонов и точных дефектов в кристаллах (руководитель работ докт.ф.-м.наук Никитенко В.А.), люминесценция пищевых продуктов (работа выполнялась под руководством докт. техн.наук Тимошкина Е.Н.), по которым издано отдельно три монографии.
В настоящее время под руководством проф. Никитенко В.А. и Кокина С.М. ведется поиск материалов и систем для новых информационных технологий, создается центр люминесцентной диагностики широкого профиля.
Научная школа проф. Пахомовой Н.Л. (лаборатория " Исследование ферритов ") проводит исследование квантово-механической природы обменных взаимодействий и магнитной анизотропии, изучается динамика спиновых структур и магнитные фазовые переходы в ферритах. Полученные результаты известны в нашей стране и за рубежом. Они включены в Международные справочные таблицы Ландольта-Бернштейна. Н.Л. Пахомова является председателем комиссии РАН по термодинамике и технологии ферритов, и других оксидов, ведет активную работу в рамках международного сотрудничества научных центров, в которых принимают участие и студенты.
Группа профессора Ф.П.Денисова провела исследование эффекта ориентационного акустического излучения, возникающего при каналировании заряженных частиц в кристаллах. Выполненные экспериментальные работы получили применение для решения ряда прикладных проблем, в частности, на железнодорожном транспорте.
По квалификации научно-технических кадров и оснащению лабораторий кафедра "Физика-2" представляет собой коллектив, способный решать фундаментальные, прикладные и научно-методические задачи, готовить инженерные и научно-педагогические кадры, включая кадры высшей квалификации, на уровне современных требований