В зависимости от того, как определяется предмет политологии, видится и её структура. Так как мы определили политологию как интегральную науку, то её структура понимается как совокупность различных наук.
В первую группу наук входят науки, непосредственно изучающие политику, а именно:
политическая философия;
учение о политических институтах;
теория международной политики;
политическая история.
Во вторую группу входят науки, занятые изучением взаимодействия политики с другими сферами. К этим пограничным наукам относятся:
политическая социология;
политическая психология;
политическая антропология;
политическая география и др.
В политологии выделяют также два уровня - уровень теоретических и уровень эмпирических исследований.
Деление на эти уровни следует отличать от деления на фундаментальную и прикладную политологию. Если первая занята удовлетворением чисто познавательных потребностей и нацелена на развитие науки, то вторая решает практические вопросы - управление конкретными политическими конфликтами, обеспечение процесса выборов, консультирование органов политической власти и т.п. При этом фундаментальная политология может включать в себя эмпирические исследования, например изучение политических ориентаций населения, а какое-либо прикладное политологическое исследование может быть выражено в теоретическом исследовании, например, в обобщенном анализе перспектив процесса демократизации в России.