Разные методы кластерного анализа соответствуют различным подходам к созданию групп, и применение различных методов к одним и тем же данным может привести к сильно различающимся результатам. Важно помнить, что выбранный метод должен находиться в согласии с ожидаемым характером классификации, применяемыми признаками и мерой сходства.
Двумя наиболее часто используемыми методами кластеризации являются иерархический агломеративный (объединительный) метод - joining (tree clustering) и итеративный метод k-средних (k-means clustering). Рассмотрим каждый из них немного подробнее.