2015-10-13
883
Вопрос №12. Дизайн лекарственных веществ при известном строении биологической мишени. Проблемы моделирования взаимодействия молекулы с биологической мишенью, понятие о молекулярном скрининге и de novo-дизайне. Биологически активная конформация. Виртуальный скрининг, основанный на структуре мишени, его валидация.
Биологически активная конформация - это так конформация молекулы, в которой соединение находится в момент взаимодействия с биологической мишенью.
De novo synthesis refers to the synthesis of complex molecules from simple molecules such as sugars or amino acids, as opposed to their being recycled after partial degradation. For example, nucleotides are not needed in the diet as they can be constructed from small precursor molecules such as formate and aspartate. Methionine, on the other hand, is needed in the diet because while it can be degraded to and then regenerated from homocysteine, it cannot be synthesized de novo.
De novo is a Latin phrase, meaning "from the new," anew, from scratch, or from the beginning.
De novo synthesis also refers to DNA replication. Primase is an RNA polymerase, and it can add a primer to an existing strand awaiting replication. DNA polymerase cannot add primers, and therefore, needs primase to add the primer de novo.
Дизайн de-novo также описан описан в pdf-файле «molmod2_lecture» на страницах62-70. Виртуальный скрининг, основанный на мишени в частности, описан в соответствующем pdf-файле.
