Декабря 1999 был избран депутатом Государственной думы Российской Федерации третьего созыва. Председатель фракции «Отечество — Вся Россия» (ОВР) (в 2000—2001 гг.)

Два срока, с декабря 2001 по 21 февраля 2011 года занимал пост президента Торгово-промышленной палаты России.^[16]

Февраля 2011 года объявил об отставке с поста президента Торгово-промышленной палаты России. В ходе пресс-конференции, посвященной предстоящему очередному съезду ТПП, Примаков напомнил, что уже два срока занимает должность главы палаты. «Этого вполне достаточно, на этом съезде я не буду переизбираться», — сказал он. 4 марта на VI съезде ТПП официально сложил с себя полномочия президента. Новым руководителем ТПП был избран заместитель Примакова С.Катырин.

30 июня 2011 года назначен председателем совета директоров федерального сетевого оператора в сфере навигационной деятельности «НИС ГЛОНАСС», сменив на этой должности министра МЧС РФ Сергея Шойгу^[17].

Семья

В 1951 году женился на студентке Грузинского политехнического института Лауре Васильевне Харадзе^[3] (сестре ДжерменаГвишиани), которая умерла от болезни сердца в 1987 году.

Дети — сын Александр (умер в 1981 году от сердечного приступа), дочь Нана, от которой 2 внучки. Внук от сына — Евгений Александрович Примаков (творческий псевдоним — Евгений Сандро, Сандро — в честь отца (Александра)^[6]), корреспондент Первого канала, востоковед.^[18]

Нынешняя супруга — Ирина Борисовна, терапевт, в прошлом лечащий врач Е. М. Примакова.