В классификации Bergey используются следующие группы или уровни (таксоны):
Царство – лат. Regnum;
Домен –Domen;
Филум – Phylum (тип – лат.). В классификации прокариотов для обозначения этого таксона используется термин «филум», а для эукариотов – «тип»;
Класс –Class;
Порядок – Ordo;
Семейство – Familia;
Род – Genus;
Вид – Species.
Таким образом, основной таксономической единицей является вид.
Вид бактерии - это совокупность микроорганизмов, имеющих единое происхождение и генотип, сходных по морфологическим и биологическим признакам.
Для обозначения некоторых совокупностей микроорганизмов, отличающихся по тем или иным свойствам внутри вида, употребляется суффикс «вар» (разновидность, вариант), поэтому микроорганизмы в зависимости от характера различий обозначают как:
морфовары – по морфологическим свойствам;
хемовары – по биохимическим свойствам;
серовары – по антигенной структуре;
фаговары – по чувствительности к типовым бактериофагам;
колициновары – по продукции бактериоцинов;
|
|
резистенсвары – по устойчивости к антибиотикам;
геновары – по строению части генома;
биовары – по культуральным (биологическим) признакам.
Установление принадлежности к роду и виду называется идентификацией бактерий. Для идентификации необходимо изучить все свойства микроорганизмов, обнаружить эти свойства в мире микроба.
Идентификация микроорганизма происходит по набору следующих свойств:
· тинкториальный (свойства бактерий, грибов и простейших, характеризующие их способность вступать в реакцию с красителями и окрашиваться определенным образом.),
· культуральных,
· биохимических,
· факторов патогенности,
· антигенных свойств,
· отношение к фагам.
Для облегчения идентификации предложены специальные идентификационные ключи для определенных групп микроорганизмов - это наборы признаков для микроорганизма – семейства, рода и вида. Идентификации подвергаются исключительно чистые культуры организма.
Культура м/о – микробы одного вида выращенные в лабораторных условиях на искусственных питательных средах. Могут быть чистыми и смешанными.
Колония – это макроскопическое скопление бактерий одного вида, которые являются потомством одной бактериальной клетки, на поверхности или в глубине плотной питательной среды.
Чистая культура м/о – это популяция клеток (видимый рост) одного вида, выросшая на стерильной питательной среде методом механического разобщения.
Штамм – разные микробные культуры одного вида, выделенные из различных источников или из одного источника, но в разное время. Могут быть идентичными или различаться по отдельным признакам. (водным штамм, фекальный штамм)
|
|
Клон – генетически однородная популяция микроорганизмов, полученная из одной микробной клетки.
Популяция – совокупность микроорганизмов одного вида, выросшая в данном объеме среды за определенное время. Например, популяция Salmonella typhi северных регионов отличается от популяции южных регионов.
Описание таксономических единиц в определителях даются в следующем порядке.
1. Структурные особенности (форма, размер, специфика спорообразования, движение, культуральные свойства, окраска по Граму);
2. Биохимические свойства и характер питания;
3. Физиологические свойства (потребность в кислороде, температурные условия, рН, чувствительность к антибиотикам);
4. Экологические особенности;
5. Генетические особенности;
6. Характер штаммов.
Название вида микроорганизмов в соответствии с бинарной номенклатурой.
Согласно бинарной номенклатуре название вида микроорганизма состоит из родового и видового названия. При этом название рода пишется с заглавной буквы, а вида – со строчной: Staphylococcus aureus (S.aureus), Escherichia coli (E.coli). При повторном упоминании вида родовое название сокращается до начальной буквы, например E. Coli.
Род – фамилия автора, открывшего м/о или по морфологии бактерии, вид – морфология бактерий, место обитания в организме, географическое место выявления, клинические признаки. Например, Стафилококк золотистый – staphylococcus – гроздь винограда, шар, aureus - золотистый, Кишечная палочка – Escherichia – Эшерих, учёный, выделевший бактерию, coli – кишка, брюшнотифозная палочка - Salmonella – Сальмонь (ученый) typhy – туман, бред, Клостридиум тетани (столбняк) – Clostridium – веретено, tetani – судороги.
Вопрос № 1. Посеяли биологический материал на плотную питательную среду. Выросли разные по внешнему виду колонии микроорганизмов. Это чистая культура?
Вопрос № 2. Взяли биологический материал у пациента А и пациента Б, посеяли. В обоих случаях свойства чистой культуры оказались одинаковыми. Это один и тот же штамм микроорганизмов?