Организована по типу брюшной нервной цепочки с хорошо развитыми надглоточными ганглиями, которые образуют примитивный головной мозг, однако, делящийся на отделы: передний, средний и задний.
Как правило, очень хорошо развиты различные органы чувств. Остановимся немного подробней на строении глаза.
Глаза у членистоногих бывают двух типов: простые и сложные (фасеточные). Фасеточные глаза характерны для представителей ракообразных и насекомых. Паукообразным свойственны простые глаза.
Половая система
Особи, как правило, раздельнополы. Присутствует половой диморфизм: внешние отличия особей разных полов.
Бесполое размножение отсутствует. Способность к регенерации выражена очень слабо.