В 2011-2012 учебном году действовали договора о совместной деятельности с нижеследующими научно-исследовательскими, образовательными и другими учреждениями и организациями:
v Институт биохимической физики им. Н.М. Эммануэля РАН, г. Москва (ИБХФ РАН),
v КБГАУ (кафедра землеустройства и природопользования),
v ИЭГТ КБНЦ РАН,
v ГОУ ВПО КБГУ (биологический, химический факультеты),
v Гербарий ботанического института им. В.А. Комарова (БИН РАН),
v Институт консалтинга экологических проектов,
v СЮН, г. Чегем,
v ИПК и ПРО КБГУ,
v ФГНУ «Северо-Кавказский научно-исследовательский институт горного и предгорного садоводства»,
v Министерство природных ресурсов и экологии КБР,
v Ботанический сад КБГУ,
v Городской детский филиал №5 Централизованной библиотечной системы г. Нальчика,
v ГУ «Республиканский социально-реабилитационный центр для несовершеннолетних МТ и СР КБР»,
v Департамент образования и науки г.о. Нальчик,
v МОУ СОШ №3, 9, 11, 16, 18, 21, 25, 27, 30, 31;
v НШДС №60;
v МОУ «Школа-интернат СОО№3»;
v МОУ «Гимназии №1, 3, 14, 29»;
v МОУ «Лицей №2»;
v Прогимназия №41.
В отчетном году на базе Центра продолжают работать региональные отделения Общероссийского общественного детского экологического движения «Зеленая планета», Всероссийского конкурса детских экологических проектов «Человек на Земле» и Российского национального конкурса водных проектов старшеклассников.