ДНК ферментативным методом

Полученные фрагменты ДНК разделяют в полиакриламидном геле с точностью до нуклеотида. Затем проводят радиоавтографию и по картине распределения фрагментов в четырёх пробах устанавливают нуклеотидную последовательность ДНК (рис. 8.22б).

Располагая такой информацией, можно локализовать на ДНК биологически важные участки. Так, например, показано, что репликация вируса SV 40 всегда начинается в одном специфическом фрагменте и продолжается в обоих направлениях. Рестрикционные карты и рестрикционные фрагменты были также использованы для картирования участков ДНК, на которых синтезируются м-РНК для вирусных белков.

В настоящее время расшифрованы последовательности большинства прокариотических организмов. Из эукариот полностью секвенированы геномы дрожжей, риса, нематоды, дрозофилы, мыши, человека и др.Существует огромное количество компьютерных программ, позволяющих проводить компьютерный анализ полученных секвенированных последовательностей, в том числе в сравнении с уже известными последовательностями.

Сразу вслед за разработкой быстрых методов секвенирования появились столь же быстрые и простые методы синтеза сравнительно длинных олигонуклеотидов с определённой, заранее заданной последовательностью. Теперь довольно легко можно синтезировать последовательность до 100 нуклеотидов. Автоматизация этой процедуры значительно облегчает и ускоряет синтез.